dr. PM (Peter) Bourke

Mijn onderzoek richt zich op twee aspecten: het ontwikkelen van veredelingsstrategieën voor gediversifieerde teeltsystemen en het ontwikkelen van tools en methoden voor veredeling in polyploïde gewassen.

Veredeling voor gediversifieerde teeltsystemen

De voordelen van gewasdiversificatie zijn overduidelijk (zie bijvoorbeeld de meta-analyse van Beillouin et al.), maar het is veel minder duidelijk hoe nieuwe cultivars of populaties voor dergelijke systemen ontwikkeld kunnen worden. Mijn onderzoek op dit gebied combineert kwantitatieve genetica en experimentele ontwerpprincipes met ecologische theorie en stochastische simulatie om strategieën en tools te ontwikkelen die de extra complicatie van plant-plantinteracties bij selectiebeslissingen kunnen aanpakken. Een deel van dit onderzoek wordt momenteel uitgevoerd binnen het CropXR-project.

Tools en methoden voor polyploïde gewassen

Ik ben de ontwikkelaar en beheerder van twee R-pakketten voor de genetische analyse van autopolyploïden.

• polymapR is een R-pakket voor het uitvoeren van linkage mapping in uitkruisende autopolyploïde F1-populaties.
• polyqtlR is een R-pakket dat QTL-mapping mogelijk maakt in outcrossing autopolyploïde F1-populaties, terwijl het ook informatie biedt over meoitische processen in de ouders, in het bijzonder verschijnselen zoals dubbele reductie, multivalente vorming en gedeeltelijke preferentiële chromosomale paring.